崇义县位于江西省西南边陲，地处东径113°55′~114°38′，北纬25°24′~25°55′之间。东与南康县接壤，南与大余县和广东省仁化县相交，西与湖南省汝城县、桂东县毗邻，北与上犹县交界。东西长约73公里，南北宽约59公里，总面积2206.27平方公里。距赣州市90公里。
境内山脉纵横交错，群峰起伏连绵，中部阳岭海拔1259.5米，北部石牙头海拔1333米，东部牛轭潭海拔140米，西部诸广山脉齐云山海拔2061.3米，西南花皮山海拔1581米，东北部陡水水库，水域海拔170米，全县地势由西南向东北方向倾斜。按地貌特征，全县大致可分为中山、低山、高丘陵、河谷阶地四种类型。山地（海拔500米以上）占土地总面积47.67%；高丘（海拔300～500米）占45.06%；低丘及河谷阶地（海拔300米以下）占7.27%。全县1000米以上的山峰有232座。其中西北部思顺乡的齐云山海拔2061.3米，为境内最高点，也是赣南最高的山。
崇义的江河属长江流域赣江水系，是章水干流重要的支流。河流以大江、小江、扬眉江为主，文英、上堡、思顺、金坑、聂都、义安、新溪等河次之，累计有大小河流83条，其中流域面积大于20平方公里的有30条，小于20平方公里而大于5平方公里的有53条，总长度980.9公里。平均河流密度每平方公里0.441公里。
崇义县地处中低纬度，属中亚热带季风湿润区，冬夏两季盛行季风，全年热量丰富，四季分明，雾日多，日照偏少，雨量充沛，空气湿度大，无霜期长。但由于地形复杂，垂直高度差异大，山上山下，向阳面和背阳面，气候差异十分明显。
崇义属常绿阔叶林生物气候带，适宜各种植物的繁衍。至今保留白垩纪末和第四纪冰期后孑遗的单科单属单种树种银杏。此外，国家一级保护树种有银杏、南方红豆杉、伯乐树、水杉、秃杉。国家二级保护树种有长苞铁杉、闽楠、浙江楠、楠木、花榈木、厚朴、野茶树、杜仲、福建柏、观光木、鹅掌楸11种；国家三级保护树种有穗花杉、油杉、凹叶厚朴、红花木莲、黄山木兰、天竺桂、沉水樟、半枫荷、白桂木、白辛树、华南栲、青钩栲等14种。全县森林资源丰富，树木种类繁多。林木树种有123科，892种，有“江西省绿色宝库”之称。
崇义森林茂密，气候温暖，适宜各种动物的生存和繁衍。国家一级保护动物有金钱豹、南方花鹿、蟒、黄腹角雉等；二类国家保护动物有金猫、獐、鹰、猫头鹰、苏门羚、毛冠鹿、山黑鹿、水黑鹿、穿山甲、水獭、小灵猫、大灵猫、白鹇、红腹锦鸡、娃娃鱼15种。
